Hay muchos estudios que relacionan ya la ingesta de probióticos diversos con la mejoría de diversas afecciones intestinales o de origen intestinal. Bifidobcterium breve B3 M-16V es uno de ellos, con el cual se han hecho específicamente estudios en relación a la dermatitis atópica en niños pequeños, aunque también parece ser eficaz en adultos. Se piensa que esta relación directa entre enfermedad y probiótico se debe principalmente a la interacción del probiótico sobre el sistema inmunológico presente en el intestino, sistema éste muy importante no solo localmente sino de forma sistémica. Es muy probable que la mejora del equilibrio probiótico de la zona haga que el sistema inmunológico de la mucosa (placas de Peyer, etc) mejore en su actividad productora de células de diversos tipos para combatir las enfermedades autoinmunes, las alergias, etc.

B. breve es una bacteria anaeróbica y ácido láctica, que produce en sus procesos fermentativos de los restos de comida ácidos tales como ácido láctico y ácido acético, que al disminuir el pH intestinal se evita el crecimiento de bacterias patógenas que alteran el funcionamiento del sistema inmunológico y por otro lado este hecho apoya al buen funcionamiento del sistema inmunológico.

Además de las alergias alimentarias en bebés y la dermatitis atópica, estos probióticos interfieren en muy diversos  trastornos, tanto relacionados  con el sistema inmunológico como probablemente el síndrome de intestino irritable o la enfermedad de Crohn o la colitis ulcerosa, que al parecer mejoran, como con trastornos no claramente relacionados con el sistema inmunológico, como la gripe, diarreas, diarrea del viajero, hepatitis, mastitis, paperas, enfermedad de Lyme, tumores, metabolismo lipídico, infecciones pulmonares en niños.

En la vagina este probiótico evita la proliferación de Candida albicans.

La escasez de esta bacteria se ha relacionado con la diarrea en niños, diarreas asociadas a antibióticos, alergias, gases, síndrome de intestino irritable.

Se piensa también que aparte de la acción a nivel del sistema inmunológico, estas bacterias probióticas pueden impedir la adherencia y proliferación de bacterias patógenas. Pero la teoría más sobresaliente va dirigida hacia el sistema inmunológico, tanto el innato como el adaptativo. Un desequilibrio en la respuesta inmune por alteración de la mucosa intestinal puede dar lugar a la aparición de patógenos relacionados con enfermedades alérgicas, como rinoconjuntivitis o asma.

Se ha visto también que este probiótico y otros mejoran el estreñimiento y desde luego, la intolerancia a la lactosa.

Se ha descrito que los probióticos pueden modular la respuesta inmune en animales y humanos no sólo a nivel de la mucosa intestinal, sino también a nivel sistémico. Dadas sus propiedades inmunomoduladoras, actualmente se evalúa la utilidad de los probióticos en el manejo preventivo o terapéutico de enfermedades inflamatorias. El consumo de probióticos podría tener un efecto positivo en la salud humana en algunas situaciones que pueden alterar el balance de la microbiota intestinal e influir en la respuesta inmune del individuo, tales como la alimentación con fórmulas infantiles, el tratamiento con  antibióticos, los cambios fisiológicos relacionados con el envejecimiento, las enfermedades gastrointestinales y el estrés. Los mecanismos de interacción de los probióticos con las células del sistema inmune son diversos. En el caso de las bacterias ácido lácticas, se ha observado que pueden ser captadas por las células M presentes en el epitelio y facilitar la estimulación del tejido linfoide asociado a la mucosa intestinal. Las células dendríticas pueden capturar bacterias probióticas al tener prolongaciones citoplasmáticas que pueden acceder al espacio luminal. Muchos de los efectos inducidos por los probióticos dependen de la interacción del microorganismo con la célula dendrítica,